GistのURLを構成しているハッシュ値的な値を使ってcloneします。そのままcloneすると分かりづらいので、ディレクトリ指定でcloneするのが良いと思います
$ git clone git@gist.github.com:ab123456789012345678901234567890.git my_gist
あとは普通にローカルcommitしてmasterにpushすれば反映されます。 master以外のremote branchを作った場合はブラウザからは見えないですが、cloneするとあります。
